Кафедра создана в сентябре 1957 года. Первой ее заведующей стала профессор Спивак Ривекка Яковлевна (1957-1960 гг.) – выпускница Харьковского медицинского института.
В 1960-1962 гг. кафедрой руководила доцент Серебряная Софья Павловна, также выпускница Харьковского медицинского института.
В течение последующих 10 лет (1962-1971 гг.) заведующим кафедрой был профессор Лащевкер Матвей Вениаминович – выпускник Одесского медицинского института.
В 1971-1976 гг. кафедрой заведовала профессор Савина Полина Николаевна, закончившая Томский медицинский институт.
В 1976-1983 гг. кафедру возглавлял профессор Бененсон Ефим Владимирович, выпускник Свердловского мединститута. В этот период сотрудники кафедры начали научные исследования по проблеме клинической иммунологии и ревматологии. Под руководством профессора Бененсона Е.В. были выполнены 1 докторская и 4 кандидатские диссертации.
С 1983 по 2003 гг. заведующей кафедрой была профессор Иванова Райфа Латыфовна – выпускница 1-го выпуска Семипалатинского медицинского института. Под ее руководством было защищено 4 докторских и 26 кандидатских диссертаций. Является заслуженным профессором Медицинского Университета Семей.
С 2003 по 2018 гг. заведующей кафедрой была профессор Жумадилова Зауреш Кенжекановна – выпускница Семипалатинского медицинского института. Под ее руководством. были защищены 1 докторская, 3 кандидатские и 3 магистерские диссертации. С 2018 года является профессором кафедры факультетской терапии.
Большой вклад в подготовку врачебных кадров внесли в свое время работавшие на кафедре доценты: Пищагина Л.А., Романова Э.В., Овсянникова Р.С., Уалиева Т.М., Оспанова Ш.Н., Немцов Б.Ф., Мальцев В.Г., Вайнцвайг П.М., Алибекова Р.И., Курумбаев Р.Р., Пивина Л.М., ассистенты: Гейликман Е.М., Драбкина Э.М., Виноградов Н.И., Корниенкова А.А., Визе-Хрипунова М.А., Поряков А.Н., Лялюкова Е.А., Омарбекова Ж.Е., Уразалина Ж.М., Батенова Г.Б.
С 2018 года заведует кафедрой факультетской терапии кандидат медицинских наук, доцент Каскабаева Алида Шариповна.
В настоящее время кафедра факультетской терапии продолжает оставаться одной из ведущих кафедр Медицинского Университета Семей. На кафедре внедрены многие инновационные образовательные технологии (CBL, OSCE, стандартизированные пациенты, клинические симуляции, интегрированные занятия, мини-клинический экзамен, интегрированный клинический симпозиум и пр.), которые повысили эффективность изучения студентами основ внутренних болезней.
По итогам рейтинга ППС по учебно-методической работе и научной деятельности, сотрудники кафедры и кафедра факультетской терапии, в целом, ежегодно занимает призовые места по номинациям «Лучшая клиническая кафедра», «Лучший преподаватель».
Основными направлениями научной работы кафедры являются вопросы клинической кардиологии, ревматологии, нефрологии и гастроэнтерологии.
Все сотрудники кафедры имеют высшую квалификационную категорию специалистов различных направлений внутренних болезней и оказывают лечебно-консультативную помощь в Университетском госпитале и лечебных учреждениях города и области.
На кафедре проходят обучение студенты бакалавриата, интернатуры и резидентуры по всем разделам внутренней медицины.