1954 жылы Семей мемлекеттік медицина институтында микробиология кафедрасы құрылды. Алғашқы меңгеруші болып кафедраның педагогикалық, әдістемелік және ұйымдастырушылық жұмыстарының негізін қалаған Исаак Карлович Бабич болды. 1963 пен 1965 жылдар аралығында кейіннен Благовещендік медициналық институтының микробиология кафедрасында меңгеруші болған, Александра Николаевна Ковалевская басқарды. 1965 және 1986 жылдар аралығында меңгерушілік қызметте медицина ғылымдарының докторы, профессор Хатмуш Лутфуллиевич Галикеев болды. Көп жылдар бойы И. К. Бабич, содан кейін Х. Л. Галикеев Бүкілодақтық микробиологтар, эпидемиологтар және инфекционистер қоғамының жергілікті бөлімін басқарды. 1986 жылдан бастап кафедра меңгерушісі Марат Маутканович Уразалин болды.
2018 жылдан бастап кафедра меңгерушісі м.ғ.к., доцент Рахимжанова Фарида Сергазиновна.
Көптеген жылдар бойы кафедрада студенттік ғылыми үйірме жемісті жұмыс істеуде. Издан учебник «Кафедрада қазақ тілінде «Микробиология» оқулығы (бірлескен авторы М.М.Уразалин), қазақ және орыс тілдерінде «Жалпы және жеке вирусология» оқулығы (авторлар О. А. Заворохин, М. В. Абишева – «Эверо» – 2017), «Микробиология» пәні бойынша «Медициналық терминологиялық сөздік» орыс, қазақ және ағылшын тілдерінде (авторы О. А. Заворохина, М. Т. Абишева – Семей – 2017) басып шығарылды.