Совет директоров НАО «Медицинский университет Семей» создан Приказом № 3 и.о. Министра здравоохранения Республики Казахстан от 06.01.2022 г.
Совет директоров осуществляет общее руководство деятельностью Медицинского университета Семей, за исключением решения вопросов, отнесенных законодательными актами Республики Казахстан или Уставом к исключительной компетенции Единственного акционера и Правления ВУЗа. Решения Совета директоров принимаются в порядке, определенном Уставом НАО «Медицинский университет Семей».